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生态系统退化的因素包括自然因素和人为干扰两大类，早期生态系统的退化主要是自然灾害等因素引起；工业革命以来，人为干扰在生态退化中起不可忽视的主导作用。
(1)自然因素
生态系统中，无论是生产者，消费者，还是分解者，它们的生存和生命活动均与栖息地的土质、温度、降水、风力等自然因素密切相关。如地震、火山、滑坡、崩塌、泥石流、鼠虫害、冰川、冰雹、洪水、干旱、海啸、寒流、暴雨、飓风等这些地质灾害、气候灾害均会破坏生态系统中的生存空间、土壤肥力，造成水土流失、土壤退化、生物种类和数量的减少，生态系统的功能丧失。例如，气候干旱，使生态系统内水源枯竭，土层疏松而干燥，土壤肥力不够，植物种类与数量显著减少，相应的动物种类与数量也明显减少，系统生产力下降；此外，由于干旱，地表松散，产生了大量沙粒和粉尘，最终形成了风沙气候。
秘鲁的海面，每隔六至七年就发生一次海洋变异现象。水温升高，来自寒流系的鱼类大量死亡；鱼类的死亡使以鱼为食的海鸟无法生存。仅1965年发生的死鱼事件，就使1200多万只海鸟饿死。海鸟的大量死亡，导致鸟粪锐减，农田减产，良好的海洋生态系统被破坏，寒流是罪魁祸首。
草原鼠害可以破坏草原生态系统。黄河源区鼠类以高原鼠兔和高原田鼠为主，对草地的破坏性极大。鼠类不仅啃食草根，造成植物死亡；而且挖穴掘洞，破坏土壤。一只成年鼠兔日食青草70g，全年食草量达20-30ks。高原鼠兔严重区有效洞穴可达2100个/km2。鼠害不仅引起草场植被的退化演替，而且掘出的大量沙土在雨水和风力的侵蚀下，造成沙漠化的扩展。
(2)人为干扰
尽管自然灾害给生态系统造成的危害巨大，损失惨重，但是自然灾害的发生并不是频繁而连续的，而且危害只涉及灾害发生的地区，影响范围不是很广。而人为干扰在加速生态系统的退化上具有不可推卸的责任。
人类是生态系统中最活跃、最积极的因素。千百年来，随着科技的进步，生产力的发展，社会需求的增加，人类以不同的方式愈来愈强烈地干扰着自然生态系统的稳态。人类用自己强大的技术力量不停息地向大自然宣战，改造自然，征服自然，主宰着大自然的命运。
“对于每一次这样的胜利，自然界都报复了我们。每一次胜利，在第一步都确实取得了我们预期的结果，但是在第二步和第三步却有了完全不同的、出乎预料的影响，常常把第一个结果取消了。”恩格斯(《自然辩证法》)说过，“人类不要过分陶醉于我们对自然界的胜利，”而“要警惕大自然的报复。”恩格斯以深刻的语言表达出人为破坏生态的危害。
人类对生态系统的干扰方式多种多样，归纳起来，有如下两大方面：对生态系统的结构的干扰，即由于人类对自然资源的无度索取，引起自然生态系统结构的变化，如砍伐森林、过度放牧、乱捕滥猎，围湖造田等，造成了生态系统的结构性失衡；对生态系统的功能的干扰，即由于大量工业和生活废弃物排人自然界，改变了原有的生态系统自我调节、自我净化的能力，造成了生态系统的功能性失衡。
2 什么是水环境系统生态修复？利用的是何种生态学原理
生态修复是在生态学原理指导下，以生物修复为基础，结合各种物理修复、化学修复以及工程技术措施，通过优化组合，使之达到最佳效果和最低耗费的一种综合的修复污染环境的方法。
生态修复的顺利施行，需要生态学、物理学、化学、植物学、微生物学、分子生物学、栽培学和环境工程等多学科的参与。对受损生态系统的修复与维护涉及生态稳定性、生态可塑性及稳态转化等多种生态学理论。
生态修复的对象是生态系统，因此，需要了解生态系统的一些基本属性，如生态系统的结构与功能、物理化学环境、生态系统中动植物群落的演替规律，需要了解生态系统的优势物种或旗舰物种，还需要认识生态稳定性、生态可塑性以及生态系统的稳态转化等。只有这样才能确定生态修复的目标，才能制定有效的生态修复措施与技术组合。
如何利用微生物生态学的原理来控制环境中的有害微生物
大量研究表明，对水域的水环境污染进行有效治理的前提是控制污染源，只有外源得到了有效控制，作为末端治理技术的水环境污染治理才能见效，不然只能起到事倍功半的效果，甚至徒劳。通过大量研究与实践，已明确水环境污染实际上是典型的生态问题，因此，在对污染水域进行治理时，用生态学方法使生态问题得到最终解决。近年，强调治理与生态修复相结合，甚至更加强调生态修复的作用。
从广义上讲，所有的生物处理都是生态修复。目前，国际上据原理已在使用的或已进入中试阶段的污染水域治理与生态修复技术可分为物理法、化学法和生物/生态法三大类。其中的技术名称包括底泥疏浚、人工增氧、生态调水、化学除藻、絮凝沉淀、重金属化学固定、微生物强化、植物净化、生物膜。（见表）
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二、微生物生长的控制途径
1. 遗传学特性 2. 培养基组成 3. 培养条件
三、微生物生长的控制因素
（一）化学因素
1.杀菌剂又称为抗微生物剂，是一类能够杀死或抑制微生物生长的化学物质。 可分为抑菌剂、杀菌剂和溶菌剂。
2.抗代谢剂抗代谢剂就是与生长因子结垢类似的特殊化学物质。
3.抗生素 抑制细菌细胞壁合成、破坏细胞膜、干扰氧化磷酸化以及抑制蛋白质和核酸合成。
4. pH(氢离子浓度) 每种微生物都有其最适pH值和一定的pH范围。
5.氧化还原电势对好氧菌的影响较大。
6.盐、碱和金属离子 影响渗透压
微量的金属离子对微生物的生命活动有着重要作用。
（二）化学因素
1. 温度
每种微生物都有自己的生长温度三基点：最低生长温度、最适生长温度和最高生长温度；此外还有致死温度。
根据微生物最适生长温度的高低，将微生物分为三类。 温度对生长速率的影响为曲线型。
温度升高时，生长速率倍增，但超过最适生长温度时，生长速率都很快下降。 大多数微生物对低温有较强的抵抗力，低温下微生物生长代谢缓慢甚至停止。
微生物对高温较敏感，高温对菌体蛋白质、核酸、酶有破坏作用。 2. 电磁辐射 紫外线、γ射线、X射线 3. 渗透势
细胞内溶质浓度与胞外溶质浓度（如0.85％NaCl溶液）相等时的状态，称为等渗状态。
溶液的溶质浓度高于胞内溶质浓度，则称为高渗溶液，能在此环境中生长的微生物，称为耐高渗微生物。当溶质浓度很高时，细胞就会脱水，发生质壁分离，甚至死亡。盐渍（5%～30%食盐）和蜜饯（30％～80％糖）可以抑制或杀死微生物，这是一些常用食品保存法的依据。
若溶液的溶质浓度低于胞内溶质浓度，则称为低渗溶液，微生物在低渗溶液中，水分向胞内转移，细胞膨胀，甚至胀破。
4. 干燥
水分活度（Activity of the water, Aw）是用来表示微生物在天然环境可人为环境中实际利用游离水的含量。是指在相同条件下，密闭容器内该溶液的蒸汽压(p)与纯水蒸汽压(p0)之比，即Aw= p/p0 。
干燥环境(aw＜0.60～0.70）条件下，多数微生物代谢停止，处于休眠状态，严重时引起脱水，蛋白质变性，甚至死亡，这是干燥条件能保存食品和物品，防止腐败和霉变的原理。不同微生物在不同的生长时期对干燥的抵抗能力不同。 一般细菌AW min=0.90 酵母菌AW min=0.88 嗜盐细菌AW min=0.75 霉 菌AW min=0.80 耐渗透压酵母菌AW min= 0.60 四、微生物生长的控制方法 （一）微生物生长的控制理论
1. 微生物生长速率与营养物质浓度
2. 微生物生长的连续培养理论
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